Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm23676-201ENSMUST00000157314 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NipblQ6KCD5 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NipblQ6KCD5 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms