Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Znf48Q3US17 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Znf48Q3US17 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms