Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shroom4Q1W617 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Shroom4Q1W617 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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