Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Trim71Q1PSW8 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms