Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25045-201ENSMUST00000122670 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VgfQ0VGU4 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VgfQ0VGU4 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms