Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd1Q01822 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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