Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RabggtbP53612 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RabggtbP53612 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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