Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
Rpl28P41105 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Rpl28P41105 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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