Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PtprmP28828 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PtprmP28828 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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