Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
P10404 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
P10404 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
P10404 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
P10404 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
P10404 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
P10404 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.59□□□□□ -2
P10404 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
P10404 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
P10404 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
P10404 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
P10404 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
P10404 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
P10404 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
P10404 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.56□□□□□ -2
P10404 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
P10404 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
P10404 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
P10404 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
P10404 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms