Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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Nedd9O35177 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Nedd9O35177 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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Nedd9O35177 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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Nedd9O35177 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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Nedd9O35177 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Nedd9O35177 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Nedd9O35177 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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Nedd9O35177 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Nedd9O35177 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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