Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
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Zfp558E9Q1J0 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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Zfp558E9Q1J0 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Zfp558E9Q1J0 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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Zfp558E9Q1J0 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
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Zfp558E9Q1J0 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
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Zfp558E9Q1J0 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
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Zfp558E9Q1J0 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Zfp558E9Q1J0 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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