Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc6D3YZP9 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.8 ms