Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Spocd1B1ASB6 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Spocd1B1ASB6 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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