Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms