Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CtcflA2APF3 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CtcflA2APF3 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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