Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Cln8Q9QUK3 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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