Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1Q9JM13 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Rabgef1Q9JM13 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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