Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Zbed3Q9D0L1 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Zbed3Q9D0L1 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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