Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Ccdc47Q9D024 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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