Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg3Q9CPX6 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Atg3Q9CPX6 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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