Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Bco2Q99NF1 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Bco2Q99NF1 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms