Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ddb2Q99J79 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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