Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Usp38Q8BW70 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp38Q8BW70 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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