Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Atg4cQ811C2 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Atg4cQ811C2 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Atg4cQ811C2 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Atg4cQ811C2 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Atg4cQ811C2 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Atg4cQ811C2 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4cQ811C2 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.9 ms