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| Hoxa13 | Q62424 | Gm23324-201 | ENSMUST00000157421 | 131 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22349-201 | ENSMUST00000157864 | 107 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22384-201 | ENSMUST00000158187 | 104 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Olfr681-203 | ENSMUST00000215517 | 4324 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | n-R5s158-201 | ENSMUST00000104095 | 118 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23320-201 | ENSMUST00000104462 | 127 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm24390-201 | ENSMUST00000179578 | 62 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23190-201 | ENSMUST00000180307 | 64 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC125167.1-201 | ENSMUST00000198698 | 141 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm45456-201 | ENSMUST00000210841 | 243 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25130-201 | ENSMUST00000082650 | 156 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mir218-1-201 | ENSMUST00000083669 | 110 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22828-201 | ENSMUST00000083768 | 107 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC159625.1-201 | ENSMUST00000220994 | 2625 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr251-202 | ENSMUST00000214865 | 4930 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Tlr3-201 | ENSMUST00000034056 | 4407 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Zfp616-205 | ENSMUST00000178159 | 2964 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Igkv4-63-201 | ENSMUST00000103351 | 286 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | n-R5s26-201 | ENSMUST00000104601 | 122 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14536-201 | ENSMUST00000118324 | 138 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14843-201 | ENSMUST00000119596 | 212 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15027-201 | ENSMUST00000120922 | 138 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm26105-201 | ENSMUST00000157253 | 190 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mir6405-201 | ENSMUST00000184584 | 124 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC132384.11-201 | ENSMUST00000219676 | 178 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22686-201 | ENSMUST00000082847 | 100 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm36669-201 | ENSMUST00000201757 | 3650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr394-202 | ENSMUST00000214284 | 5562 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |