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| Foxd1 | Q61345 | AC154515.1-201 | ENSMUST00000226085 | 2841 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1370-204 | ENSMUST00000215806 | 4322 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24890-201 | ENSMUST00000104389 | 102 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24288-201 | ENSMUST00000157630 | 144 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm26405-201 | ENSMUST00000158495 | 100 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm26022-201 | ENSMUST00000158663 | 108 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Hmgb1l-201 | ENSMUST00000082150 | 571 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr896-ps1-202 | ENSMUST00000215219 | 2878 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mir466b-3-201 | ENSMUST00000103806 | 81 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm44477-201 | ENSMUST00000199661 | 110 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm15235-201 | ENSMUST00000200572 | 194 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | N4bp2os-201 | ENSMUST00000201547 | 235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm26493-201 | ENSMUST00000083155 | 136 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm10351-201 | ENSMUST00000087694 | 125 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Vmn2r69-201 | ENSMUST00000171213 | 2553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Zfp160-201 | ENSMUST00000088811 | 3791 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Pak3-203 | ENSMUST00000112864 | 8612 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr726-204 | ENSMUST00000215105 | 1752 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr640-202 | ENSMUST00000218535 | 4009 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | n-R5s26-201 | ENSMUST00000104601 | 122 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23651-201 | ENSMUST00000116755 | 120 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm11712-201 | ENSMUST00000129139 | 367 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Mir21b-201 | ENSMUST00000184317 | 108 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm45654-201 | ENSMUST00000210980 | 123 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | AL627387.1-201 | ENSMUST00000226063 | 250 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24410-201 | ENSMUST00000083433 | 107 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Zfp985-201 | ENSMUST00000081742 | 2762 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm15302-201 | ENSMUST00000117779 | 2630 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Ifi203-205 | ENSMUST00000129829 | 3054 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm22673-201 | ENSMUST00000104415 | 131 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mir1298-201 | ENSMUST00000116681 | 98 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm11285-201 | ENSMUST00000118443 | 322 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23588-201 | ENSMUST00000157659 | 99 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm27369-201 | ENSMUST00000185182 | 71 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm29603-201 | ENSMUST00000186792 | 334 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mir3073b-201 | ENSMUST00000199383 | 60 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23140-201 | ENSMUST00000082487 | 107 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm25814-201 | ENSMUST00000082754 | 107 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | CT009504.1-201 | ENSMUST00000218252 | 3330 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm22003-201 | ENSMUST00000101885 | 107 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm13885-201 | ENSMUST00000117569 | 187 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24598-201 | ENSMUST00000122510 | 74 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm12510-201 | ENSMUST00000152190 | 362 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm26406-201 | ENSMUST00000158503 | 124 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23548-201 | ENSMUST00000158963 | 106 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm23410-201 | ENSMUST00000179967 | 107 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm22756-201 | ENSMUST00000180118 | 107 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |