Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms