Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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