Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Rpusd3Q14AI6 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Rpusd3Q14AI6 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Rpusd3Q14AI6 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Rpusd3Q14AI6 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rpusd3Q14AI6 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rpusd3Q14AI6 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Rpusd3Q14AI6 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms