Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hif3aQ0VBL6 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hif3aQ0VBL6 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hif3aQ0VBL6 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hif3aQ0VBL6 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hif3aQ0VBL6 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms