Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd1Q01822 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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