Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RabggtbP53612 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RabggtbP53612 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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