Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RxraP28700 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RxraP28700 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
RxraP28700 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RxraP28700 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RxraP28700 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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