Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Vpreb1P13372 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Vpreb1P13372 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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