Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Nedd9O35177 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Nedd9O35177 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Nedd9O35177 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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