Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Tmem200cJ3QK46 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Tmem200cJ3QK46 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms