Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Zfp558E9Q1J0 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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Zfp558E9Q1J0 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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Zfp558E9Q1J0 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Zfp558E9Q1J0 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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