Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc6D3YZP9 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc6D3YZP9 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms