Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc9bA3KGF9 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc9bA3KGF9 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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