Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rtf1A2AQ19 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rtf1A2AQ19 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms