Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn8Q9Z260 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn8Q9Z260 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn8Q9Z260 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn8Q9Z260 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn8Q9Z260 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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