Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cln8Q9QUK3 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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