Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Rabgef1Q9JM13 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms