Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms