Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RabggtaQ9JHK4 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms