Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp29Q9ES63 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms