Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zbed3Q9D0L1 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zbed3Q9D0L1 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms