Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc47Q9D024 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc47Q9D024 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms