Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Ddb2Q99J79 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ddb2Q99J79 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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